蛭弧菌以其天然、无污染、无残留的特点在水产养殖业中具有广阔的发展前景,替代抗生素，已成为水产养殖中的重要菌剂。
蛭弧菌制剂发酵过程中产生的代谢产物可分解、转化水中的亚硝酸盐，改善养殖水体水质,减少蛋白态氮向氨和胺转化,从而减轻水中氨和有机质污染。蛭孤菌微生态制剂可有效利用养殖水体中的含氯化合物,使养殖水体中的氨氮、亚硝酸态氮快速降解,有效改善养殖水质。蛭弧菌的具体作用如下：
一、预防水生动物细菌性疾病
抗生素的长期使用容易使病原菌产生耐药性，利用蛭弧菌对病原菌独持的寄生和裂解特性，可有效清除养殖水体及水生动物体内的病原菌减少病原菌数量,使其无法达到致病密度，以达到防治病害、提高成活率的效果。蛭弧菌具有取代抗生素的潜力,成为控制水生动物疾病的新手段。蛭弧菌作为水体自净的生物因子,可有效清除河水中的大肠杆菌、沙门氏菌和不凝集弧菌。
二、治疗水生动物细菌性疾病
蛭弧菌可以裂解气单胞菌、假单胞菌、弧菌等，且裂解率高达70%以上，避免水产养殖业遭到细菌性疾病的侵袭，保障水产养殖业健康发展。蛭弧菌的效应时间较长，是理想的预防水产养殖细菌病害的微生物菌剂之一。
三、提高水生动物免疫活性
蛭弧菌进入水生动物肠道后，在聚糖酶、肽酶等酶的作用下释放细胞壁中的肽聚糖或者其它免疫物质,从而发挥免疫增强剂的功能，刺激溶菌酶活性,增强与鱼类免疫功能相关酶活性。从而提高鱼类、虾类、贝类等水产动物的免疫力，降低发病率。
四、有利于水产养殖的鱼虾品质
蛭弧菌能够通过裂解引起水产品变质的病原菌,达到水产品长期保鲜的目的。预防大肠杆菌、霍乱弧菌、副溶血弧菌、沙门氏菌等细菌引起的食物中毒。蛭弧菌是关系到水产品品质和经济效益的重要微生物菌剂。